Trường THCS An Thạnh tiền thân là Trường THPT Hồng Ngự 1 toạ lạc tại ấp An Thạnh A2 thị trấn Hồng Ngự; nằm giữa 2 con đường lớn là đường Hùng Vương (Quốc lộ 30) và đường Ngô Quyền, với tổng diện tích mặt bằng được giao là 27.334 m2. Trường được xây dựng vào năm 1990 ban đầu chỉ vỏn vẹn có 12 phòng học kiên cố lầu. Sau đó phát triển dần được 30 phòng gồm 25 phòng học và 5 phòng chức năng.
Đến tháng 08/2000 do yêu cầu phát triển, trường THCS thị trấn được thành lập theo Quyết định 390/QĐ-UB ngày 26/7/2000 của UBND huyện Hồng Ngự trên cơ sở vật chất và mặt bằng của trường THPT Hồng Ngự 1.